要彻底打破集团过去存在的跟主要领导拉关系、跑官要官的用人“潜规则”，消除“土围子”、“小山头”、政令不通、各自为政等现象，必须深入组织整顿，在集团内部建立沟通顺畅、科学完善的管理体系，建设一支高效核心管理团队。正如孙晓民总经理所提出的，未来三九的核心管理团队，不是职业经理人，而是有强烈的责任心和事业心，有较强的创新能力、精细化管理能力的三九人。这就是我们深入组织整顿的目标。
深入组织整顿，必须坚持德、才兼备的用人标准。对于“德”，除了应具备作为一个党员、作为一个社会人所应具备的基本优良品德之外，集团特别强调思想观念必须适应建设新三九的要求，认同并牢固树立“八个观念”，具备责任意识、大局意识和奉献精神。对于“才”，集团特别强调能够以三九事业为重，敢负责任，敢抓敢管，能够创造性地开展工作，想干事并且能干成事。
　　深入组织整顿，必须将组织整顿与思想整顿相结合。思想整顿能够清除各种落伍的不适合形势发展的思想，培养优秀的企业文化，提高干部员工的思想政治水平，确保组织的纯洁性。在新的历史发展时期，只有思想上的先进性问题解决了，才能为保持组织的先进性提供重要的思想基础。因此，需要将思想上的整顿与组织上的整顿进一步结合起来，真正解决组织上存在的问题。
　　深入组织整顿，必须将组织监督与个人自律相结合。在当前形势下，既要强化领导集体的内部监督，还要拓宽监督渠道，充分发挥基层员工的监督作用，通过完善各种监督机制，保证各级干部与集团党委保持一致。同时，组织监督还要与各级员工，特别是领导干部的自律结合起来。自律包括自重、自省、自警、自励等方面，要通过各种培训教育，使他们明确自己的权利与义务，严格要求自己，以身作则，严以律己，不断地加强个人修养，提高素质，以承担重任。
　　深入组织整顿，必须将组织整顿与制度建设相结合。组织整顿确保了集团组织结构的纯洁性，但要想使组织整顿的成果得到巩固，还必须从制度上来解决问题。“绝对的权力必然导致绝对的腐败”，制度建设更带有根本性。这就要求在组织整顿中，必须注意解决好制度建设问题。从制度上解决问题，最根本的就是要进一步坚持和完善党的民主集中制的组织制度和领导制度，建立完善现代企业制度，充分发挥各级人员的积极性。
　　深入组织整顿，是一项系统工程。目前，集团通过“四项整顿”和巡检等工作，虽然在组织整顿方面取得了一定成效，但与建设新三九的要求还有差距。因此，深入组织整顿任重道远。